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Illumina 850k芯片

產品介紹

    Illumina 850k甲基化芯片

    Illumina 850k甲基化芯片特點

    ① 權威甲基化芯片,針對人源樣本研究性價比高;
    ② 高準確度可精確達到85萬個甲基化位點;
    ③ 覆蓋范圍廣,CpG島及CpG島以外均有覆蓋;
    ③ 多種驗證手段可供選擇。

    Illumina 850k甲基化芯片介紹

    人類的許多疾?。òò┌Y)是由于異常的甲基化引起的。Illumina甲基化芯片是一種DNA甲基化高通量篩選技術,精確到單個堿基的甲基化變化。單堿基分辨率實現了基因區域和CpG島的全面覆蓋。此外,還包括CpG島之外的CpG位點、在人類干細胞中鑒定出的非CpG甲基化位點、miRNA啟動子區域以及腫瘤和正常組織中差異表達的甲基化位點等,大大加速了甲基化研究發展,提升研究效率,并很有可能發展成為人類疾病診斷、預防和治療的有效工具。

    Illumina 850k甲基化芯片技術特點

    ■ 流程簡單,無需進行繁瑣的免疫共沉淀;
    ■ 直接檢測到發生甲基化的準確位點,而非發生甲基化的區段;
    ■ 可根據需求,靈活定制符合自己需求的個性化芯片;
    ■ 通量高,可一次性檢測8個以上樣品。

    Illumina 850k甲基化芯片技術流程

    Illumina 850k芯片技術流程-歐易生物

    Illumina 850k甲基化芯片分析流程

    Illumina 450k芯片

    Illumina 850k甲基化芯片技術參數

    Illumina 850k芯片技術參數-歐易生物

    案例展示

    案例一:I期非小細胞肺癌的DNA甲基化標志物

    為了探索I期非小細胞肺癌(NSCLC)可利用的生物標志物,本案例采用 Illumina 450K甲基化芯片對444例非小細胞肺癌樣本進行研究,發現了10000個甲基化差異位點?;谶@些位點進行非監督層次聚類分析,可以將患者明顯區分為預后好壞兩類。

    Illumina 850k芯片技術案例:I期非小細胞肺癌的DNA甲基化標志物-歐易生物
    圖1. 非小細胞肺癌樣本的非監督層次聚類分析

    案例二:甲基化芯片轉錄組聯合分析

    本案例利用Illumina 450K甲基化芯片研究了多發性硬化影響的腦組織與正常腦組織的DNA甲基化差異,結果發現甲基化差異細微,但是差異是普遍存在的并且具有可重復性。通過RNA-seq研究發現,多發性硬化影響的腦組織相比正常腦組織,調節少突膠質細胞存活的基因,如BCL2L2和NDRG1是高甲基化的并且基因表達水平較低;而與蛋白水解加工相關的基因,如LGMN和CTSZ則是低甲基化并且基因表達水平較高。這些結果表明基因甲基化程度的改變會影響腦組織對于損傷的敏感性。

    Illumina 850k芯片技術案例:甲基化芯片與轉錄組聯合分析-歐易生物
    圖2. mRNA表達水平與啟動子甲基化相關性分析

    參考文獻

    [1] Sandoval J, Mendez-Gonzalez J, Nadal E, et al. A Prognostic DNA Methylation Signature for Stage I Non–Small-Cell Lung Cancer. Journal of Clinical Oncology, 2013; 31(32): 4140-4147.
    [2] Huynh J, Garg P, Thin T, et al. Epigenome-wide differences in pathology-free regions of multiple sclerosis- affected brains. Nature neuroscience, 2014; 17(1): 121-130.

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