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三代大基因組測序

產品介紹

    三代大基因組測序

    簡介



    與二代測序最高不超過1 Kb的讀長相比,PacBio Sequel的長讀長將有效解決短序列數據的拼接難題。同時,與二代測序的模板樣品需要擴增相比,PacBio Sequel無需擴增可直接對單個分子進行測序,有效避免了PCR擴增偏好性和GC偏好性,PacBio Sequel可輕松跨越GC含量異常(過高或過低)及高度序列重復的區域,實現序列覆蓋的完整性和均一性。



    技術流程


    技術路線

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    建庫流程

    2

     

    分析流程

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     分析內容


    基因組從頭測序

    基于單分子實時測序技術,對動植物基因組進行測序及拼接組裝(純三代組裝),解決多倍體、高雜合度、高度重復區域、異常GC含量區域等組裝難題,重新定義大基因組的組裝指標?;蚪M從頭測序,在不依賴參考基因組的情況下對某物種進行基因組測序及拼接組裝,從而繪制該物種的全基因組序列圖譜?;蚪M測序不僅可以獲得該物種的全基因組序列圖譜,同時也為后續物種起源進化及特定環境適應性的研究奠定基礎。


    4

    基因組組裝升級

    基因組組裝升級指的是利用三代測序超長讀長的數據,對已經組裝好的二代基因組進行組裝優化,即二、三代混合測序。


    5

     

    基因組結構變異分析

    基于單分子實時測序技術,通過低覆蓋深度測序,檢測動植物全基因組中結構變異,為后續重測序分析提供更豐富的變異信息,解決目前NGS測序在結構變異檢測的瓶頸,即采用低覆蓋深度測序的方式檢測基因組上存在的大片段結構變異。

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