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簡化基因組甲基化測序

產品介紹

    MethylRAD-seq(簡化基因組甲基化測序)技術于2015年11月份發表在學術期刊《Open Biology》上(Wang et al., Open Biol., 2015)。MethylRAD是利用甲基化修飾依賴性內切酶,如FspEI、MspJI、LpnPI、AspBHI等,此類內切酶會識別DNA上發生甲基化的胞嘧啶,在識別位置的下游隔一定距離進行酶切;如果DNA兩條鏈甲基化狀態是對稱的,那么就可以切割產生一個固定長度的雙鏈DNA片段(~32bp)。對酶切產生的標簽建庫測序,即可進行甲基化位點的定性和相對定量檢測。


    技術原理                                                                                         技術流程

                       

    技術優勢

    ?文庫構建簡便快速,保證了實驗的重復性、標簽的代表性,甲基化位點檢測的假陽性率能夠控制在0.5%以內
    ( WGBS假陽性率在0.28%-0.50%)
    ?具有單堿基分辨率,可以做到甲基化位點的定性和定量分析
    ?所需的樣本DNA量極低,5ng的起始DNA量即可建庫
    ?具有極強的靈活性,可以控制獲得甲基化位點的密度
    ?DNA甲基化位點的檢出不依賴于基因組序列信息,既可以用于未知甲基化位點的開發,也可用于不同樣本間的甲
    基化位點的差異研究

    技術參數


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